Werner, kaj je drugi otrok in edini sin, rodil Abraham Davidova in Regina (Holstein) Werner. Werner je oče kaj inšpektorja na vojvoda Solm je železarn. Pred vstopom v šolo pri starosti 9, Werner, kar je učil doma njegov oče in korepetitor. Leta 1764, Werner mama umrla in oče urejene za uradniški položaj v železarni. Pet let kasneje, Werner vstopil v Freiberg School of Mines z namenom priprave za službo v upravljanju v železarni. Vendar pa je spremenil svojo pot in se odločil za študij prava za kariero v rudarski službi Saxon. Leta 1771 je prestopil v Univerzi v Leipzigu, kjer je sprva prevzel pouk v zakonu. Vendar pa je po njegovih prvih dveh letih, je postal bolj zanimajo za študij zgodovine jezikov. Tako se je začelo nadaljevanje študije mineralogiji, tema storil njegov oče spodbudil, saj je bil še deček. Werner levo Leipzigu leta 1774 brez zaslužka stopnjo.
Po objavi prve knjige Werner o mineralogije v 1774, nekdanji učitelj Werner je ga priporočljivo za pozicijo kot učitelj za rudarstvo in kurator zbirke mineralov v Freiberg School of Mines. Werner je začela delo leta 1775 in tam ostal vse do svoje smrti leta 1817 V svoji karieri, Werner nadaljeval revidirati svoj program mineralna tajnosti z revizijami objavljenih leta 1789, 1816 in 1817 v najzgodnejši različici Ukvarja se s 183 vrstami, medtem ko V zadnji je pokriva 317. V prvi polovici leta 1800 videli več angleške prevode njegovih knjig.
Werner je bil zelo cenjen znanstvenik, ki je imel velik vpliv po vsej Evropi. Rodil se je v številnih organizacijah, vključno Geological Society of London, Nacionalni inštitut in Institut Imperial Francije, Imperial Društva za fiziko in medicino v Moskvi, je Royal pruske akademije znanosti in Wernerian družbe v Edinburghu.
Ko je umrl, Werner skrajni levi njegovega posestva na Freiberg, v šoli, kjer ga je poučeval za življenjsko celotno odraslih.