Proti koncu leta 1953, Oppenheimer je bil obtožen, da je tveganje za varnost v Združenih državah Amerike in v decembru 1953, je bila njegova varnostna razdalja prekinjena. Oppenheimer je bila dana možnost, da odstopi od GAC ali imajo zaslišanje. Oppenheimer zavrnil, da odstopi in zahteval zaslišanje. Med 1954 obravnav mnogi znanstveniki in javni uslužbenci potrdil zvestobo Oppenheimer je. Kljub temu, 27. maja 1954, varnostni svet zavrnil ponovno Oppenheimer je varnostno preverjanje, čeprav, kot je priznala svojo zvestobo. Čeprav AEC takoj razdrla pogodbo z njim, devet let kasneje pa ga počastili s svojo Enrico Fermi Award.
Poleg tega, da še naprej usmerjati Inštitut za Advanced Study, Oppenheimer napisal več knjig, v naslednjih letih , vključno z znanostjo in skupnega razumevanja (1954), Open Mind (1955) in The Flying trapezu. Tri kriz za fizikov (1964)
Leta 1994, upokojeni KGB (sovjetska tajna policija) na splošno trdili, V svoji avtobiografiji, ki je Oppenheimer prenašajo atomske skrivnosti v Sovjetski zvezi. Ker je spomini napolnjena z napakami, znanstvena skupnost na splošno še vedno verjamejo, da je Oppenheimer nikoli zavestno izdala svojo državo. 
[1] [2]