S kolegom, Cooper razvil sistem programske opreme, ki bi lahko prepoznali in preoblikovanje rokopisne črke v tipkanih znakov. Mednarodna Business Machines Corporation (IBM) uvedla sistem leta 1987.
Leta 1991, Cooper postal prvi direktor inštituta Univerze Brown za možgane in nevronskih sistemov. Inštitut združuje matematikov, psihologi, inženirjev, fizikov, jezikoslovci, računalniške znanstvenike in biologi za študij na delovanje možganov in živčnega sistema višjih živali, vključno z ljudmi.
Cooper je bil nagrajen s sedmimi častni stopinj. Je član Ameriške akademije znanosti in umetnosti, American Physical Society, National Academy of Sciences, American filozofsko društvo, in sponzor Federacije ameriških znanstvenikov. Leta 1968 je skupaj z Schrieffer, je prejel Comstock nagrado National Academy of Sciences.