Leta 1931, Hess je postal profesor fizike na Univerzi v Innsbrucku. Tam je ustanovil visoke nadmorske višine postajo je v Alpah za študij kozmičnih žarkov.
Leta 1937, Hess vrnil na Univerzi v Gradcu. Leta 1938 je nacistična vlada Nemčije prevzela Avstriji. Hess je bil odpuščen iz svojega univerzitetnega mesta, tako, ker je bil predstavnik ved v prejšnje neodvisne avstrijske vlade in ker je bil Roman Catholic, in njegova žena je bila judovska. Nacisti ni odobrila bodisi religije. Štiri tedne, preden so jih načrtuje, da bodo aretirali in poslali v koncentracijsko taborišče, Hess in njegova žena pobegnil v Švico. So se preselili v ZDA pozneje v tem letu.
Od leta 1938 do upokojitve leta 1956 je bil Hess profesor fizike na univerzi Fordham v New Yorku. Je postal ameriški državljan leta 1944. Leta 1946, Hess opravili teste iz Empire State Building za radioaktivnimi padavinami in kozmičnih žarkov bombardiranjem. Leta 1950 je sodeloval pri drugih študijah z radioaktivnimi padavinami od testiranja jedrskega orožja. Je osredotočena na bioloških učinkov radioaktivnosti iz obeh kozmičnim sevanjem in jedrskih poskusov.
Marie Hess je umrl leta 1955. Kasneje istega leta, Hess poročena Elizabeth M. Hoenke, medicinska sestra, ki je skrbel za svojo ženo. Hess ni imela otrok. Umrl je na december 17, 1964 
[1] [2]