Prav, koruzni etanol ne sme biti tako okolju prijazna, kot večina ljudi misli. Če rafinerije obrnil vsako uho koruze v ZDA v etanol, bi bilo zamenjati le 12 odstotkov bencina [vir: Brune]. Poleg tega kmetje uporabljajo veliko fosilnih goriv za rast in proces koruze v etanol, kar povzroči povečanje emisij toplogrednih plinov. Od kmetije do tank plina, koruzni etanol proizvede le 15 odstotkov manj atmosferski toplogredni plin kot enakovreden znesek bencina [vir: Tillman in Hill].
Nekateri biocrops lahko tudi negativno vpliva na divje živali. Znanstveniki na Univerzi v Wisconsin-Madison pravijo število vrst ptic v zgornjem Midwest lahko zmanjšale med 7 in 65 odstotkov, če bodo kmetje rastlina koruza in druge letne energetske rastline. Znanstveniki pravijo, veliko vrst, vključno s pticami, kot živijo na območjih z raznoliko rastlinsko življenje. Sajenje vrsti rastline velike, kot so soja in koruza, bi zmanjšalo biotsko raznovrstnost ptic, pravijo [vir: Tenenbaum].
Strokovnjaki pravijo, če bomo izbrali naše energetske pridelke pametno, da imajo potencial, da svet z okolju prijazno energijo. Vendar je vprašanje za milijon dolarjev res je, ki biocrops moramo rastejo, in kjer bi jih morali rastejo?