Leta 1963 je polkovnik Enrique Peralta Azúrdia vodil uspešen upor. Z odlokom je urejena, vendar je obljubil, da imajo volitve, potem ko je sprejela novo ustavo. Ustava je začela veljati leta 1965 in civilna vlada je bila izvoljena. To je poskus gospodarske in socialne reforme, vendar so njeni programi pa so ovirale odpora konservativnih poslovnežev in bogatih lastnikov zemljišč. V 1970-ih in zgodnjih 1980-ih, je bila reforma nadaljnje zamude s serijo konzervativnih vojaških vlad, ki so bili izvoljeni sredi obtožb nasprotnikov volilnih prevar.
nova ustava Leta 1986 je začela veljati in je bila obnovljena civilna vlada. Vendar pa vlada korupcija in kršitve človekovih pravic ostala probleme v 1990-ih. Leta 1994 je vlada in komunistični gverilci podpisala sporazum o krepitvi človekovih pravic. Leta 1996 je vlada in gverilci podpisali mirovnega sporazuma, ki se konča s 35-letno državljansko vojno. Orkan Mitch povzročile obsežno škodo na državo leta 1998.