Brskanje članek Zgodovina Panama Uvod v zgodovino Panama
karibski obali Paname je bil raziskati španskega ekspedicijo pod Rodrigo de Bastidas približno 1500. je regija, kjer živi več plemen Indijanci se CUNA čemer je največji. Leta 1502 je Krištof Kolumb odplul ob obali v osrednjem delu ožine in trdil območje za Španijo. Severna obala Panami je bil kraj prve španske naselbine na celini.
Leta 1509 je španska vlada izdala licence Alonso de Ojeda in Diego de Nicuesa za poravnanje regije preučevanih Bastidas in Columbus. Prve kolonije so bili ustanovljeni leta 1510 v San Sebastianu (o tem, kaj je zdaj severni obali Kolumbije) in Nombre de Dios. Niso zaživela, pa zaradi bolezni, lakote in spopadov z Indijanci. Prvi uspešen naselje, Santa María, je bila ustanovljena leta 1510, ko je Vasco Núñez de Balboa prepričan naseljenci v San Sebastianu, da se premaknete na novo mesto na zahodni obali zaliva Darien. Indijanci na novo spletno stran je bila hitro umirjena in Balboa postal guverner nove kolonije. Leta 1513 Balboa je svojo pot čez ožine in odkril Pacifika.
New World voženj Balboa je. Manjša zemljevid prikazuje pot Vasco Núñez de Balboa je iz Španije na Karibih v 1501. Večji zemljevid prikazuje njegove poti po Karibskem morju. Med 1501 in 1502, Balboa pluli vzdolž severne obale Južne Amerike in do Hispaniola. Pomagal je ustanoviti kolonijo Darien leta 1510. Leta 1513, Balboa prečkal ožine Panami in slabovidne na Tihi ocean.
Balboa je bila zamenjana v ukaz, in kasneje usmrtili, ki jih Pedrarias de Avila, ki je leta 1519 osnovana mesto Paname na južni obali ožine, ki služi kot sedež vlade. Francisco Pizarro je leta 1531 začel svojo osvojitev Peruja iz novega mesta. Kamnita cesta je bila zgrajena iz Panama City Portobelo, in vse zlato, srebro in dragulje, vzete iz perujskih rudnikih opravili čez njo se naložijo v španskih galleons na karibski obali.
Privateers drugih evropskih državah, zlasti Anglija, nadlegujejo španskega Main (celinska). Leta 1572 Francis Drake zasegli mule vlak zaklad prečka isthmus. V času njegove smrti leta 1596 se je pripravljal na napad Portobelo. Pristanišče je bil posnet leta 1601, ki ga William Parker, in je bil odpuščen leta 1668 Henry Morgan, ki se je vrnil leta 1671, da plenjenje in spali Panama City. Leta 1698 škotski družba poskušala podtakniti kolonijo na Kaledonija zalivu, vendar španščina jih pregnali. Britanski Admiral Edward Vernon ujeli Portobelo leta 1739. Leta 1746 Špan