Državljansko vojno obdobje
Zakon o Kansas, Nebraska (1854) pričelo obmejna vojna Missouri, Kansas kot pro- in anti-suženjstvu skupine poskušali zmagati vpliv nad Kansas. Pro-suženjstvu Missourians, imenovane "obmejni rokovnjačem," narejen oborožene napade čez mejo, in Kansas Abolicionisti maščeval. Bil Boji v glavnem ustavila leta 1859, vendar pa je le dve leti kasneje Missouri spet je bila raztrgana konflikti ko se je začela državljanska vojna.
Čeprav Missouri dovoljeno suženjstvo, ni odcepili od Unije. Na začetku državljanske vojne, guverner Claiborne F. Jackson, ki je naklonjena jug, je bil odstavljen s četami Unije. Ta ukrep je pripeljalo do prvega zemljišč bitke vojne borili na Boonville v juniju 1861. Sledila je avgusta ob večji angažiranosti pri Wilsonovi Creek (blizu Springfield). Missouri je nadlegujejo vsej vojno Konfederaciji gverilskih skupin kot so Quantrill je Raiders.
kasnejši razvoj
Po vojni, Missouri vpisana dolgo obdobje okrevanja in prilagajanja. radikalnega Republikanci potekala moč za kratek čas, vendar je bilo razseljenih s strani demokratov, ki je zmagal na volitvah od leta 1872 in v zadnjem četrtletju ostal prevladujoč politično silo 19. stoletje.
Ko so reke glavni poti in parnikov je glavni način prevoza, je imel Missouri tesne vezi z New Orleansu in na jugu. Vendar pa, kot so železnice razširiti in steamboating upadla, je država postala bolj tesno povezal s severa in vzhoda. St. Louis in Kansas City rasla v velikih industrijskih mestih. Mnogi evropski priseljenci so bili privlači teh novih proizvodnih centrov. Plače ostala nizka, vendar pa je bil razširjen industrijski nemiri, z delavci presenetljivo, da zahtevajo reforme. Slišati je bilo tudi veliko podeželja nezadovoljstvo. Čeprav so bili sprejeti izboljšane metode kmetovanja in je proizvodnja povečala, kmetje niso postali uspešni.
V zgodnjih letih 20. stoletja, upravami reform guvernerjev Joseph W. Folk (1905-1909) in Herbert W. Hadley (1909-1913), sponzorira številne napredne ukrepe. So bile sprejete neposredna primarna pobuda, in referendum. Monopoli so bili preganjani. Železnice so pod strožjim nadzorom, in javnih služb ter dela otrok je bilo urejeno.
Prvi dve desetletji 20. stoletja je bila uspešna. V zgodnjih 1920-ih, pa kmetijske cene drastično padle, in kmetijstv
