Leta 1856 je Dakota Land Company tvorijo zemljišč špekulantov, ki so upali, da ustvarite novo ozemlje iz bogate kmetijske površine zahodno od Minnesota ozemlja. Naselja so se začeli na Medary, Flandreau in Sioux Falls, na Big Sioux River. Leta 1857, ko je Minnesota začela priprave za državnosti, je bilo območje med Big Sioux in Missouri rek (zdaj vzhodna polovica Južni Dakoti) označi, da postanejo neorganizirano ozemlje. Naselja hitro poskočil na Yankton in Vermillion, v Missouriju.
Večina naseljencev so izrinile Sioux, vendar je leta 1858 Yankton Sioux podpisali pogodbo. So odstopil vse svoje dežele med Big Sioux in Missouri v ZDA, razen 400.000 hektarjev (162.000 ha). Ko je senat ratificiral pogodbo leta 1859, več sto naseljencev preselil v novo odprtih regiji.
Naseljenci hitro ustanoviti svoje lastno vlado in peticijo kongres vzpostaviti novo ozemlje. Kongres sprejel zakon ustvarja Dakota ozemlju, in predsednik Buchanan je bil podpisan 2. marca 1861. Ozemlje vključene vse sedanje Severni in Južni Dakoti in delov Montana in Wyoming. Yankton je bila narejena teritorialni kapital. Montana je bila narejena ločeno ozemlje leta 1864, Wyoming v 1868.
Gold Rush in indijski Troubles
Med 1860 poravnave novega ozemlja je bil počasen, kot državljanske vojne in strah pred Indijanci poguma priseljevanja. Sioux vstaja, ki se je začela v Minnesoti leta 1862 razširila na Dakoti, ki povzročajo začasno opustitev večine mest. Nadaljnje težave s Sioux pripeljala do Laramie pogodbi iz leta 1868, s katero je bila celotna zahodna polovica sedanjega Južni Dakoti dano v Sioux kot rezervacijo. Območje je bilo zaprto za vse beljakov.
Leta 1874, v odgovor na agitacijo, ki ga belci, ki so želeli, da se odpre prostor za poravnavo, podpolkovnik George A. Custer je bilo naloženo, da vodi vojaško ekspedicijo, da razišče Black Hills , del Sioux dežel. Kot je stranka ogled Black Hills, je odkril zlato na francoskem Creek, v bližini sedanjega mesta Custer. Ko je novica o odkritju dosegla vzhodnih mest, rudarji začeli vlijemo v regiji. Veliko rudarskih taborišča so bila ustanovljena v kratkem času, vključno z Rapid City, Deadwood in svinec. Zlata mrzlica je prinesel tudi železnico do Dakota ozemlja.
Bela vdor v Black Hills, sveto, Indijanci, je privedla do Sioux vojno 1876. Večina Sioux predajo po kratkem času in podpisal mir pogodba, s katero jim je dal gor Black Hills in se dogovorili, da se premaknete
