Ko je Jefferson postal predsednik leta 1801 je Louisiana Nakup še ni bila izvedena in območje okoli povirja Missouri in Columbia rek je še vedno neraziskana jih belci. Ta velika regija ni bila del Združenih držav Amerike in njegov status je negotov; je bilo rečeno, da spadajo v Franciji ali Španiji ali Veliki Britaniji, ali pa nihče.
Eden od prvih ukrepov Jefferson novega uprave je, da se zagotovi ustrezno preučitev te regije, je verjel, da je bogata s krznom, les in minerali. V zimi 1802-03 kongres strinjal, da prilastitve $ 2500 za ta namen. Jefferson je organiziral zabavo kot vojaške ekspedicije ki ga je poslala v vojno ministrstvo.
Meriwether Lewis, Jefferson osebni tajnik, je bila dana v ukazu. Lewis je zahteval, da se William Clark, stari prijatelj in kolega vojak, je co-vodja odprave. Lewis je dobil kapetanski provizijo in Clark je bila narejena s poročnikom. Lewis zavrnil priznanje razliko v čin. Clark je bila naslovljena kot "kapetan" od začetka do konca in se imenuje "kapetan" na ta dan.
Lewis in Clark bili možje izjemne telesne in mentalne sposobnosti, in dobro delali skupaj kot ekipa. Oba imata dolgoletne izkušnje na življenje v divjini in reke potovanja. Lewis je bil naravni vodja in imeli več znanstvenih um. Clark je bil kvalificirani frontiersman z genijem za pogajanja z Indijanci.
Zanimivosti o Lewis in Clark expeditionFor njihovim vodstvom, Meriwether Lewis in William Clark vsaka prejela 1.600 hektarjev (650 ha) zemljišč kot nagrad. Preostali del moških dobil dvojno plačo in 320 hektarjev (130 ha). Tolmač Toussaint Charbonneau prejeli dodaten $ 533,33 za svoje storitve. Njegova žena Sacagawea dobil nothing.The raziskovalci šli skozi, kaj je sedaj 11 držav: Illinois, Missouri, Iowa, Kansas, Nebraska, South Dakota, North Dakota, Montana, Idaho, Oregon, in Washington.Sacagawea, edina ženska, da bi krog potovanje, rodila dečka, Jean Baptiste, na februar 11, 1805. Po ekspedicije, Charbonneau in Sacagawea vprašal Clark dvigniti in izobraževati fanta, in on agreed.Seve
