Kraka ustvaril tehniko ugotoviti strukturo holesterola jodida, sterola, ki je prvi kompleks organski material, ki se popolnoma določi z rentgensko kristalografijo. Uporaba tisoče matematičnih izračunov, Hodgkinov sestavila diagram holesterola molekule prikazuje gostoto elektronov jih prizadele rentgenskega žarka. Ta gostota map navedeno, kjer so se nahajali atomi. Nato je ustvaril umetni kristali, ki so identične naravnim razen da vsebuje dodaten atom težkega elementa. Rentgenske fotografije umetnih in naravnih kristalov je v primerjavi zapolniti manjkajoče dele strukture kristala je.
Dobila je doktorirala iz Cambridgea leta 1937 in nadaljeval poučevanje na Oxfordu, za preostanek svoje kariere.
Leta 1937, Kraka poročen Thomas L. Hodgkin, zgodovinar. Jih hranijo svoja delovna mesta, razen med tednom, vendar so preživeli konec tedna skupaj. Par je imel tri otroke.
Med drugo svetovno vojno (1939-1945), Dorothy Kraka Hodgkin pridružil skupini znanstvenikov, ki skušajo ugotoviti strukturo penicilina, močno zdravilo, ki se uporablja za zdravljenje okužb, ki jih povzročajo bakterije. Leta 1945, Hodgkin in njeni kolegi uspelo.
Po drugi svetovni vojni, Hodgkin pomagala vzpostaviti Mednarodne zveze Crystallography. Se je pridružila tudi več organizacij, ki si prizadevajo za mir v svetu. Ker nekatere od teh organizacij sprejete komuniste v času, ko je ameriška vlada nasprotuje komunizmu, je Hodgkin včasih omejena v svojih potovanjih v Združenih državah Amerike.
Leta 1947, Hodgkin bil izvoljen za člana (članice), Kraljeve družbe , vodilna znanstvena organizacija v Združenem kraljestvu.
Leta 1948, Hodgkin začel delati določiti strukturo vitamina B12. Znanje o molekularni strukturi vitamin, bi pomagalo znanstvenikom bolje razumeti, kako telo uporablja to snov za izgradnjo rdečih krvnih celic in prepreči bolezen, imenovano slabokrvnostjo, ki se pojavi, ko vitamin B12 ne more absorbirati v telo. Ta podatek bi bilo koristno, da zasvojenosti podjetja, ki so želela izdelati kemično obliko vitamina B12 za ljudi, ki ne morejo dobiti dovolj naravnega vitamina od njihove hrane.
Hodgkin lotil dela z ekipo raziskovalcev. Prav tako je sodeloval z Kenneth Trueblood, ki je vodil skupino