Čeprav univerzalnih skenerji (znan tudi kot ". Naprej in nazaj branju " skenerji) obstajajo, ki lahko bere različne frekvence, večina živalskih zavetišč nimate teh skenerjev. Da bi bile stvari bolj zapletene, družbe, ki mikročipi ne želijo to univerzalno skener, da so združljivi z njihovo opremo. Ta podjetja želijo, da ljudje še naprej kupujejo njihove skenerji in mikročipe, zato poskrbite, da lahko le njihovi skenerji berejo svoje mikročipi. To storite tako, da šifrira frekvenco, pri kateri je mikročip prebere. S šifriranjem, podjetja bi bilo tako samo skenerji s pravilnim algoritma lahko dekodira radijski signal, ki ga oddaja mikročipa. Crystal Uvoz, podjetje, ki distribuira ISO-združljive mikročipi celo vložila tožbo proti hišne Microchip podjetja navdušen in Digital Angel trdijo njihovi taktika kršil protimonopolne zakonodaje, ki želi prisiliti, da razkrije kodo za šifriranje [vir: O'Connor].
naveličani s podjetji, ki še naprej uporabljati kHz frekvenco 125 in šifriranje svojih mikročipe, Banfield hišne bolnišnice skočil na ISO bandwagon leta 2004 in začel vsaditi tisoče hišnih živali z mikročipi, ki uporabljajo ISO 134,2 frekvenco. Vendar Banfield niso pričakovali težav, bi to ustvarilo za ameriške lastnike hišnih ljubljenčkov. Ker večina zavetišča ZDA nimajo ISO-združljive skenerje, ki jih morda skeniranje ljubljenčka in ne zazna mikročip. To je točno to, kar se je zgodilo v enem tragični primer: Lastniki hišnih imenuje zavetje dobesedno pol ure po tem, ko se je položila microchipped psa spati [vir: AMACA]. Potem ko je bila narejena ta srčno-breaking napaka, California sodišče je Banfield stop vsaditev ISO-združljive žetone v hišne ljubljenčke. Zdaj, Banfield priporoča, da vaš ljubljenček dobil dva mikročipi - tako ISO-združljiv (134,2 kHz) čip in eno z 125 kHz frekvenco skupnim do [vir: Banfield] v ZDA.
Da bi pomagali ublažiti frustracije ki prihaja iz te nezdružljivosti, predsednik Bush podpisal zakon v letu 2006, ki zaračunavajo inšpekcijske službe za zdravje živali in rastlin (APHIS) s standardizacijo mikročipi. Vendar APHIS izvaja le nadzor nad organizacijami, ki so urejene z Zakonom o dobro počutje živali (AWA), kar pomeni, da nima moči, da narekujejo, kaj lastniki zasebnih hišnih in maloprodajna podjetja storiti [vir: USDA]. Predlog zakona ne, pa pomeni, da lahko delajo, da pomagajo standardizirati mikročipe, ki se uporabljajo v obj
