Retrovirusi zanašajo na beljakovin katalizator, imenovan proteaza encim kot del njihovega reprodukcijskega procesa. Zaviranjem tega proteina vrže opica ključem v retrovirus "stroje uničenja. Dejansko so takšni zaviralci proteaz že uporablja za zdravljenje okužbe z virusom HIV pri bolnikih z AIDS-om [vir: Britannica].
Na žalost, dražila iz strukture teh proteinov je eden izmed najtežjih ugank vemo. Predstavljajte si, da izpolnite velikan škatlo z zapletel božična drevesa luči, opuščenih Vitek igrače, bodečo žico, lepilnim trakom in elektromagnetov, nato pa tresenje in lahkota okrog, in končno poskuša uganiti, kakšno obliko bi si naredil. Vi ste začeli samo praska površino kompleksnosti te naloge. Beljakovine lahko sestavlja več kot 10.000 atomov komad, ki tvorijo verige, sub-verige in vezi v nešteto kombinacijah; v resnici, obstaja več načinov za preklapajo beljakovino, kot je atomov v vesolju [vir: BOHANNON].
Ta kompleksnost je več kot celo superračunalnik lahko včasih ravnati, še posebej zato, ker računalniki niso posebej dobri delo z tridimenzionalnih oblik. Torej, so znanstveniki začeli iskati za hitrejše in bolj učinkovitimi sredstvi tresk proteinskih struktur. Njihova rešitev? Uporabite prirojene sposobnosti prostorska analiza človeških možganov. Foldit je bil rojen. Skoraj takoj, se je začelo izplačevati dividende.
V naslednjem poglavju bomo pobliže ogledali, kako Foldit deluje, kar so igralci dosegli z njo in ali ne pozdraviti z virusom HIV.
Molekularna Clockwork
Bistven del obrti v urarstvo sestavlja montaža zbirko občutljivih delov znotraj kot kompaktnem prostoru, kot je mogoče, hkrati pa zagotavlja, da je tesen četrtine ne motijo funkcijo Ura je.
V Foldit igralci uporabljajo preprost škatlo orodij manipulirati obliko proteina. Ideja je v zavoj, zasuk, premikanje in stresamo stranske verige proteina in hrbtenice aminokislinskih tako, da je celotna konstrukcija pakiramo v optimalni formi. Igralci vedo, njihova rešitev deluje, ko se jih znebite trkov med stranskimi verigami atomov, skriti hidrofobne verige znotraj proteina, soočiti s hidrofilne verige navzven in odstranite velike prazne prostore, ki ogr
