Discovery znanje
/ Knowledge Discovery >> Discovery znanje >> znanost >> znanosti o življenju >> celični mikroskopsko biologija >>

Kako Microbiome Project Human Works

erenčni nabor mikrobnih genomov sekvenc (cilj je bil 3.000 zaporedja). Druga faza (2013-2015) vključuje razvoj nekakšen katalog podatkov microbiome določa, da bi raziskave znanstvene skupnosti in bolezni študija in zdravje. Imajo tudi širše, zahtevno nalogo preiskuje povezavo med mikrobne združbe osebe in različne bolezni in stanja.

Zakaj je ni bilo to storjeno že prej? Tehnologija ni obstajala. Ni bilo res tako znanstveniki študija prebivalce microbiome ker jih ne bi bilo mogoče goji ali izolirani v okolju laboratorija. Vendar z vnaprej sekvenciranja in tehnologije DNK so znanstveniki sedaj sposobni izolirati genskega materiala iz mikrobnih združb, ne da bi jih gojiti [vir: NIH]. In tako se je projekt začel leta 2007 s proračunom v višini $ 170 milijonov EUR in dokaj enostavno opravilo. Odvzemanja vzorcev z dovolj veliko število zdravih ljudi za določitev izhodišča ali okvir tega, kar človek microbiome pomeni

Prvi faza se je začela z novačijo prostovoljce, ki so menili, " zdravo ". To ni bila lahka: 600 preiskovancev med 18 in 40 so prinesli, vendar po strogih izpitov (za stvari, kot so votline in vnetjem, kot tudi splošnega zdravja), več kot polovica je bilo zavrnjenih. Dvesto dvainštiridesetih predmeti iz Houstona v Teksasu, in St Louis, MO, končno izpolnila merila, in so bili srečneži, ki se odvzame bris več krajev na večkrat, nato pa so se njihova BIOME zaporedje več kot 200 znanstvenikov na 80 različnih institucij [vir: Kolata].

Vsak človek je vzorčenje v 15 krajih, in vsaka ženska v 18. (na račun za mikrobno okolje nožnice), vsak do trikrat več kot dve leti. Vzorce vključeni področja črevesja (vzete iz blata), nosu in več mest v ustih in na koži.

Tekom študiji, smo dobili več kot 11.000 vzorcev, in znanstveniki so lahko zaporedje del RNA materiala za identifikacijo mikrobov, kot tudi določi velikost populacije [vir: Baylor College of Medicine]. Tako daleč, 800 vzorcev šla skozi celotno zaporedje genoma [vir: Baylor College of Medicine]. Projekt je ustvarila nekaj velikega 3,5 trilijona bajtov podatkov, ki je tisočkrat več kot Genome Project Human [vir: Baylor College of Medicine].

National Institutes of Health financiranja skupnega sklada je bila uporabljena do leta 2013 , vendar je projekt, potem se je začela sama financira skozi 16 sodelujočih NIH inštitutov [vir: Mole]. Znanstveniki še vedno vzpostavljajo strožje protokole vzorčenja in poskušata najti osnovo tehnično podporo in vire.
Ug

Page [1] [2] [3] [4] [5]