V zgodnjem kolonialnem obdobju je bila Panama upravni okraj v viceroyalty Peruja. Leta 1739 pa je bila združena s Kolumbijo v viceroyalty New Granadi. Ko trgovina upadla po 1746, Panama izgubila svoj gospodarski pomen in je bila odpravljena njena samostojna uprava. Zatem je bila urejena od Bogoti.
Panama Pod Kolumbija
Leta 1821 Panama osvojil svojo neodvisnost od Španije, in se pridružil novi Republike Greater Kolumbije. Razen v obdobju 1840-41, ko je revolucija Tomás Herrera vodil, ki Panama neodvisen za 13 mesecev, je ostal del Kolumbije do 1903.
Zlata mrzlica v Kaliforniji leta 1849, ponovno Panama uspešna kot glavna Mejni prehod od Atlantika do Pacifika, in Združenih držav Amerike in Velike Britanije se je začela ob upoštevanju možnih kanal poti. Leta 1855 United States družba zaključila železnico čez ožine. Linija cvetel, dokler je Združene države Amerike sam razpon po železnici v 1869.
Leta 1880 je De Lesseps Company, francoska družba, ki je zgradila Sueškega prekopa, je začel gradnjo kanal prek Paname, ampak je šel v stečaj pred zaključkom ga. Združene države Amerike so se dogovorili, da nadaljuje s kanalom, vendar Kolumbija zavrnil dovoljenje. Opogumljen z Združenimi državami Amerike, leta 1903 Panama razglasila svojo neodvisnost od Kolumbije. Mednarodna pogodba je bila podpisana lizing v ZDA trak zemljišča, imenovan Panama Canal Zone, na obeh straneh proge predlaganega Canal je, in tudi o pooblastilu poseg v notranje zadeve Panama Združene države Amerike, ki je zagotavljal neodvisnost novega naroda . Prekop je bil zgrajen s strani Združenih držav in odprli leta 1914.
Panami kot republika
Od ustanovitve nove republike, Združene države Amerike so lastniški odnos do njega. Čete so bile vložene v Ugušiti motnje volitvah leta 1908 in 1917, leta 1918 so Združene države prevzela policijsko oblast nad Panami. Pridelovanje ameriško vpletenost v Paname zadeve povzročil globoke zamere, in v novi pogodbi leta 1936 so Združene države dogovorile, da politiki Neintervencija. Ta pogodba je bila ratificirana leta 1939.
Vlada Panama bil razmeroma stabilen, čeprav so predsedniki odstavil leta 1931, 1941 in 1951. Polkovnik José REMON, šef policije, ki so zasegli vlado leta 1951, je bil izvoljen za predsednika leta 1952. Leta 1955 je bil umorjen. Anti-Združene države Amerike sentiment povzročilo nemirih leta
