Inkvizicija je uradno začel z papeža Gregorja IX (papeške inkvizicije). Leta 1231 je izdal bik, ali odlok, da vzpostavi sistem razsodišče poskusiti heretike in jih kaznovati. Je izbral Dominikanci, znan za to, da zelo dobro izobraženi in dobro obveščeni o kompleksnem teologije, za izvedbo inkvizicijo.
Španska inkvizicija je edinstven v tem, je bil ustanovljen z posvetnih vladarjev, kralj Ferdinand II in kraljica Isabella z dovoljenjem papeža Siksta IV. Monarhija je bila katoliška, in to je samo združeni dve kraljestvi, Aragon in Castile kot enotno državo v poznem 15. stoletju. Razlogi za inkvizicije vključeni željo po ustvarjanju versko enotnost in slabijo lokalne politične oblasti in sorodstvenih zvez. Denar je bil še en motiv - vlada ustvarila dobiček, ki ga zaplenili premoženje tistih, spoznan za krivega herezije. Zgodovinarji domnevajo, da monarhija je prepričan papež Sikst IV, da se omogoči inkvizicijo z grožnjo, da se odstranijo španskih vojakov iz Rima, kjer so bili, potrebnega, da se prepreči napad Turčije.
Številni ugledni državljani so zaskrbljeni zaradi verske različnosti njihove države in imeli pobožne odnos do ne-katolikov. Judje so bili izpostavljeni nasilnim napadom, znanih kot pogromov in izolirane v getih. Veliko je bilo ubitih. Inkvizicija je bila uradno ustanovljena leta 1478, in Judje so bili pregnani nekaj let kasneje, ko je kralj Ferdinand II izdala Alhambra odlok leta 1492, ki jih izreče pustiti na bolečino smrti. Mnogi Judje pretvori v katolicizem. Te spreobrnjenci so včasih imenujemo marranos (Spanish za " prašiča " in zelo odstopanju izraz) in obtožen skrivaj še naprej vaditi judovstva. So postali tarče inkvizicije.
Španija osvojil Granada, regijo poseljena večinoma muslimanski Mavri, v poznem 15. stoletju. Muslimani utrpela opozicijo in preganjanja, ki je podoben Judov, dokler so bili pregnani leta 1502 v imenu verske in kulturne enotnosti. Muslimanski pretvori v katolicizem, imenovane Moriscos (španščina za " mavrska "), so bile usmerjene v istih razlogov kot judovski spreobrnjenci. V poznem 16. stoletju, protestanti, predvsem luterani, tudi postal tarča inkvizicije.
Španska inkvizicija razširila na španskih kontrolirani kolonije v novem svetu, vključno z Mehiko. Inkvizicija je bila ukinjena v Španiji leta 1834, ki ga kraljica Izabela II
bomo pogledali, kako so bili ti inkvizitornim preskušanja opravljena naslednja
italijanski fizik in astronom
