Ko se je državljanska vojna se je začela leta 1861, Kentucky razglasil " nevtralno ", ampak na koncu odločil, da ostane v Uniji. Kentuckians borili za Unijo, katere predsednik Abraham Lincoln, je bil rojen v državi, in Konfederacijo, ki ga Kentucky rodu, Jefferson Davis je tudi pripeljala. Približno 70.000 moških, vključno s skoraj 24.000 črnci, pridružil vojski Unije, medtem ko je približno 30.000 mož odšel v konfederacijski storitev. Vojakov iz obeh vojsk zasedli dele Kentucky ob različnih časih. Odločilen angažiranost v državi je bila bitka Perryville v oktobru 1862. čete Unije v okviru Splošnega Don Carlos Buell razbežali na Konfederacijske invazijo generalni Braxton Bragg je vodil. Ves čas vojne, v skoraj vsakem okrožju, so gverilske racije izvedla unije in Konfederaciji sil podobno.
V obdobju po vojni, je bil Kentucky prizorišče grenkega pretresov. Saj je ostal v Uniji, ni bilo predmet ukrepov za obnovo. Vendar pa, kot nekdanje države-slave holding, se sooča veliko istih težav kot stanj Konfederacijo.
Kentucky gospodarstvo je v razsulu. Izguba 10.000 moških kot vojnih žrtev in osvoboditev sužnjev je povzročila strm upad proizvodnje hrane. Vojna je povzročila tudi dolgotrajne grenkobo med Kentuckians ki so podprli nasprotni strani. Let nasilja sledili. V vzhodnih gorah, dolgotrajne krvi maščevanju med skupnostmi in med klani-vključno razvpiti maščevanja med Hatfields Kentucky in McCoys Zahodne Virginije, je imela svoj izvor v državljanske vojne antagonizmov. Ustrahovanje nekdanjih sužnjev je bila izvedena na s Ku Klux Klan za let po državljanski vojni.
Modern Development
gospodarstvo opomoglo v poznem 19. stoletju, podprto s povečano železniškega gradnjo, obnovo trgovine, izkoriščanja iz lesa in virov premoga vzhodne Kentucky in širitev industrije. Kljub splošnemu gospodarskemu izboljšanju pa kmetijstvo trpi zaradi odvisnosti od mnogih kmetov na eni pridelka, tobak in propad vrednosti zemljišč po Panic leta 1873. Večji premiki nacionalni protest, kot so National Grange kmetje " Alliance, in populistična stranka, ki zahteva ureditev železnice in industrije, dobil podporo v Kentuckyju. Nova ustava, ki vsebujejo robnikov na pristojnosti vlade in mon
