Ko se teorija evolucije prvič prišel na javne pozornosti v 1859 se je srečal z nevihto protesta in posmeha. Nekateri ljudje, napačno razlagalo teorijo, mislil, da je trdil, da so bili ljudje potomci opic. (Pravzaprav, teorija pravi, da so imeli ljudje in opice skupnega prednika, ki je niti človek niti opica.) Ena verska ugovor evolucije je bila, da ni ujemalo z biblično zgodbo stvarjenja.
V Združenih državah Amerike je v nekaterih državah sprejelo zakone, kar je nezakonito, za poučevanje evolucije v javnih šolah. Leta 1925 je John Scopes, učitelj v Daytonu, Tennessee, je bila vložena na sodišče zaradi kršenja tak zakon. Področji je branil Clarence Darrow, in William Jennings Bryan je bil odvetnik za pregon. Čeprav je Scopes spoznan za krivega, sojenje je pomagala končati veliko nasprotovanje teoriji evolucije, in različne antievolution državni zakoni so bili na koncu razveljavi.
V večini držav, teorija evolucije dosegla sprejem pri večini verskih skupin. Nasprotovanje teoriji ostala največja v Združenih državah Amerike, kjer je veliko skupin držati kreacionizem.
Skoraj vsi znanstveniki strinjajo o dejstvu evolucije, vendar je prišlo do več sporov v teoriji. Leta 1960 je bil glavni spor med znanstveniki neutralist šole in tiste šole selectionist. V neutralists zavrnil tradicionalno darvinizem, in trdi, da so imeli genetske lastnosti organizma, ki ne vpliva na možnosti za preživetje. Neutralist položaj izgubila podporo, ko je večina dodatnih raziskav je pokazala malo dokazov v svojo korist.
Teorija prekinjala ravnotežja je leta 1972 predlagal ameriški paleontologi Niles Eldredge in Steven Jay Gould. Je nastal spor med znanstveniki, ki so imeli to teorijo, in tistih, ki so verjeli, da je evolucija vrst ostaja na počasnem tempu. Vedno večji delež fosilnih dokazov je podprla teorijo prekinjala ravnotežja.
V poznem 20. stoletju, so izpopolnjena orodja omogočila ljudem, da preuči proces evolucije na genetski ravni. Študije genov raznih vrst so pokazale, da obstaja velika sprememba v bazenih gena ž
