Kot direktor NHGRI, Collins nadzira ameriško vlogo v genomu Project Human, mednarodnih prizadevanjih za preslikavo človeškega genoma ( celoten nabor genov v celici). Projekt človeškega genoma je začela v letu 1990, kot je program za določitev celoten niz kemičnih navodila, ki nadzorujejo dednost pri ljudeh in nekaterih drugih organizmov. Znanstveniki verjamejo, da bodo lažje našli in razumeli povezavo med geni in bolezni, z razumevanjem človeškega genoma. To znanje bo sprožila revolucijo na področju medicine. To bo vodilo k individualizirani preventivno medicino, v katerem bodo posamezniki sprejmejo genetski test, in nato prejeli zdravila ali preventivnega zdravljenja, ki temelji na njihovi osebni genetski ustroj. To bo privedlo tudi do razvoja učinkovitejših zdravil in terapij, ki temeljijo na globlje razumevanje mehanike bolezni.
Poleg preslikavo človeškega genoma, projekt je zasnovan tako, da razvijejo tehnologije, da bo pomoč raziskovalcem in zdravniki v analizi podatkov, zbrane iz genetskih testov. Projekt podpira tudi usposabljanje zbora znanstveniki uporabiti tehnologije in virov razvit v okviru projekta na načine za izboljšanje zdravja ljudi.
Še ena pomembna komponenta Genome Project Human je pregled možno etičnih, socialnih, in pravna vprašanja, ki lahko izhajajo iz raziskave človeškega genoma. Collins je bil na čelu takšnih vprašanj, ki vključujejo vprašanja o tem, kako se bodo ljudje uporabljajo svoje genetske informacije in genetsko informacijo drugih.
Collins je zahtevala tudi, da se zagotovi dostop javnosti do ugotovitev projekta, tako da lahko raziskovalci po vsem svetu ga uporabljajo za vnaprej znanje o genski? in njegove praktične aplikacije.