Težave z Drevo Življenja
Genetska Primerjava organizmov, ki jih filogenija je pokazala, resna ovira za sledenje drevo življenja nazaj do enotnega skupnega prednika, ki prej biologi niso mogli videti. Lov za skupnega prednika - in sama ideja, da je eden obstajajo - temeljijo na genskem distribucijo prek vertikalnega prenosa genov. S tem so geni opravili skupaj z ene generacije na drugo s spolnim ali nespolno razmnoževanje. Eno ali dve organizmi povzroči drugo, da podeduje repliko sebi ali predvidljiv kombinacijo svojih genov. Sčasoma se lahko organizmi sčasoma razhajajo v povsem različnih vrst ali celo kraljestev, kot ljudje iz opic (ali še dlje nazaj, kjer rod, ki je bila povod za ptice oddaljile od bakterij), vendar je ta horizontalni prenos genov še vedno pušča Pot genetskih krušnih drobtin lahko sledimo izslediti naše korenine.
To so geni prenesejo le vertikalno je prevladoval pogled znanstvenikov do leta 1950, ko je bila odkrita še ena vrsta prenosa genov. Vodoravno ali lateralni prenos genov, je še en način enega organizma pridobitev še geni, temveč od staršev na potomce, je ta metoda genske distribucije, ki temelji na enem organizem učinkovito absorbira vso DNK drugega organizma in nepoškodovano [vir: Wade]. Dve organizmi lahko ustvarite tretjo, navidez nepovezanih hibridni organizem z obeh genov, vendar nikakor ne na način, podoben enako kombiniranje genov, ki se pojavlja v času razmnoževanja. Namesto tega lahko ena večja organizem skoraj jedo drug organizem in ohraniti genetsko kodo drugega organizma, z uporabo kode prvega organizma zase. Mitohondrije, del celice, odgovorne za pretvorbo sladkorjev na energijo, ki se uporablja za pogon celičnih funkcij v evkariontskih živalih, se domneva, da so enkrat obstajala kot samostojna organizma [vir: Wade]. Skozi bočnega prenosa, starodavno Evkarionti jo absorbira in ohranila svoj genetski make-up.
Zgodnje v zgodovini Zemlje, mikrobiologi zdaj verjamem lateralni prenos je bil skupen, kar korenine drevesa življenja ni direktna linija navzgor od ena semena, temveč serija nemogoče, prepredeno prečka, praktično nemogoče izslediti linij med enoceličnih organi